La Unidad de Bibliotecas es una unidad orgánica dependiente del Instituto de Investigación, responsable del desarrollo de la información de las investigaciones en el campo de la música y afines, con el propósito de recopilar datos, producir información y ponerla al alcance de la comunidad universitaria, y gestionar la biblioteca, sonoteca y videoteca. Entre las más importantes tenemos la colección de música peruana, joyas de la música peruana (manuscritos no editados), partituras musicales, métodos, literatura musical, tesis, los fondos Francisco Pulgar Vidal, Luis Alva, Leopoldo La Rosa, hemeroteca y obras de referencia.